تحلیل آماری

برای انجام تجزیه و تحلیل گروه جفت های همسان بین انرژی تعادل شبکه های حالت استراحت و میانگین گروه انرژی های تعادل شبکه های توپولوژی تصادفی (شکل. 3الف) ، در ابتدا ، ما نرمال بودن سطح تعادل انرژی ها را با استفاده از آزمون شاپیرو-ویلکاکسون در سطح گروه آزمایش کردیم. به این ترتیب ، متوجه شدیم که توزیع انرژی-تعادل بسیار طبیعی نیست و این یافته ما را به استفاده از آمار غیر پارامتری سوق می دهد. سپس ، برای بررسی تقارن توزیع اختلاف زوجین ، از آزمون 29 مایو-ژل-گاستوایرت استفاده کردیم . نتایج نشان داد که این اختلافات نامتقارن بودند ، بنابراین ، ما از آزمون Sign که یک روش آماری غیر پارامتری برای تجزیه و تحلیل سطح گروه همسان است ، هنگامی که اختلاف جفتی به صورت نامتقارن توزیع می شود ، استفاده کردیم. ما همچنین این روش را برای درصد انواع سه گانه انجام داده ایم (شکل. 3ب)

همچنین ، برای مقایسه TMH های منفی شبکه های واقعی و TMH های منفی شبکه های پوچ (شکل. 4الف) در ابتدا از آزمونهای Shapiro-Wilcoxon و Miao-Gel-Gastwirth استفاده کردیم. آزمون Shapiro-Wilcoxon غیر نرمال بودن TMH های منفی را شبیه انرژی های تعادل نشان داد ، اما Miao-Gel-Gastwirth نتوانست فرضیه صفر تقارن توزیع اختلاف زوج را رد کند. در این شرایط ، ما دو گزینه برای تجزیه و تحلیل جفت های همسان غیر پارامتری داشتیم ، آزمون Sign و Wilcoxon نمره امضا. بنابراین ما رتبه امضا شده Wilcoxon را انتخاب کردیم که قدرت آماری بیشتری را ارائه می دهد.

ما همچنین با استفاده از الگوریتم 62 Nelder-Mead برآورد حداکثر احتمال را برای تطبیق یک مدل نمایی در توزیع درجه منفی شبکه های واقعی و استخراج پارامتر نرخ گزارشگر (شکل). 6)

علاوه بر این ، برای کشف رفتار نوظهور مناطق مغز از جنبه توزیع درجه منفی (شکل. 7) ، ما توزیع درجه منفی هر ROI را با توزیع درجه منفی کل مغز با استفاده از آزمون Kolmogorov – Smirnov مقایسه کردیم. پس از آن ، ما با استفاده از روش False Discovery Rate (FDR) که توسط الگوریتم 63 بنجامین و هوخبرگ ایجاد شده است ، مقادیر p را از مثبت کاذب ناشی از مقایسه های متعدد اصلاح کردیم .

ما برای تجزیه و تحلیل آماری و ایجاد ارقام گرافیکی از نرم افزار R 64 و برخی از بسته های آنها 65 - 69 استفاده کردیم. ما همچنین تصاویر مغزی ایجاد کردیم (شکل. 7و مکمل شکل  5 ) با استفاده از BrianNet Viewer جعبه ابزار 30 و نمودارهای رسم شده (شکل ها). 2، ، 9 ،9، و مکمل شکل  7 ) توسط Draw.io ویرایشگر نمودار آنلاین رایگان 70 .

علاوه بر این ، ما کدهای خود را در " https://github.com/majidsaberi/NegLinkTopoBalance " به اشتراک گذاشتیم . بنابراین همه می توانند کار ما را تکرار و توسعه دهند.

منبع

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7838299/